从诺禾致源肿瘤NGS多基因检测试剂盒看肺癌诊疗发展历程,肿瘤多基因检测迈入新纪元

原标题:从诺禾致源肿瘤NGS多基因检测试剂盒看肺癌诊疗发展历程

原标题:肿瘤多基因检测迈入新纪元

序言

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自2005年,吉非替尼作为第一款用于治疗NSCLC的小分子靶向药物进入市场以来,中国的肺癌精准医疗在肿瘤分子病理诊断的加持下飞速发展,回顾过去的十余年,肺癌的诊疗模式已从单一的放化疗,逐步发展为包含分子靶向治疗、免疫治疗、放化疗在内的多学科诊疗模式。不断问世的新型靶向药物为临床医生提供更多治疗手段的同时,分子病理检测技术的发展也使更精准、更精细的肺癌治疗方案制定成为可能。正如专家周彩存所言:肺癌靶向治疗必将趋于“精准化、精细化”。

2018年8月24日,illumina发布了一则五个字的简短信息

精细化精准医疗的实现

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纵观NCCN指南十年的发展历程,靶向药物的推陈出新和药物靶点的不断增加已成为非小细胞肺癌诊疗模式革新的主要驱动力。从EGFR首次进入指南到新增驱动基因列表,非小细胞肺癌的药物靶点不断增加,多基因并行检测已是大势所趋。

虽然illumina欲说还休,不过很多行业人士给予了剧透

而展望前沿临床研究,同一基因的不同突变亚型患者对靶向药物的响应具有显著差异,全面获取肿瘤变异信息是实现精细化、精准化治疗的前提。然而传统的分子病理检测手段提供的肿瘤变异信息有限,单次检测的基因数目较少,无法满足日趋增长的临床需求。

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高通量测序技术(NGS)的出现为多基因并行检测和肿瘤变异信息的深度挖掘提供了有力的工具,使肺癌精细化、精准化治疗成为可能。

开启新纪元的不止illumina,随着近期诸多检测试剂盒被CFDA批准,靶向治疗和精准医学在神州大地落地开花,国内肿瘤多基因检测领域开始正式迈入新纪元

近日,诺禾致源的“人EGFR、KARS、BRAF、PIK3CA、ALK、ROS1基因突变检测试剂盒(半导体测序法)”获得中国药品监督管理总局的上市批准。该试剂盒能够一次性测EGFR、KARS、BRAF、PIK3CA、ALK、ROS1
六个基因的突变情况,指导吉非替尼、奥希替尼、克唑替尼等肺癌靶向药物在临床的使用。试剂盒的上市拉开了NGS技术在临床规范化应用的序幕。

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新型检测方法下的治疗新思路

2018年8月24日,艾德生物又一多基因联合检测试剂盒(商品名:艾惠健)获国家药品监督管理局(CFDA)批准上市。该试剂盒可检测EGFR、ALK、ROS1、KRAS、BRAF等多个核心驱动基因,将基因突变和基因融合检测完美整合到同一个产品中,是基于PCR技术平台的多基因联合检测里程碑式的突破

敏感、耐药位点共突变下的用药策略

据悉,此次获批的人类肺癌多基因突变检测试剂盒“艾惠健”是基于其自主知识产权的ADx-ARMS®核心技术平台的创新产品,将基因突变和基因融合检测整合到同一个产品之中,操作简便、结果准确,可当天出报告,实现了不同基因变异类型的同步快速检测,满足患者得到及时诊治的紧迫需求。

2016年10月25日发表于《Clinical Cancer Research》上的一篇文章揭示,在EGFR
突变人群中如果发生了 TP53 共突变,TKI 的效果将大打折扣。TP53
野生型患者的疾病控制率(DCR)高于突变者(TP53 突变者 DCR:70%,TP53
野生型的 DCR:88%)疾病进展的相对危险度(RR):3.17 [95%CI
1.21-8.48],P = 0.019。

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TP53 突变可能参与了 EGFR-TKI 的原发性耐药。TP53 第 8 外显子突变可能为
EGFR 突变患者的一个亚组,对 TKI 类药物比较抗拒,并在 EGFR 外显子 19
缺失的患者中特别显著。新技术提供的全面的基因检测结果能够对患者进行精细分层,指导临床制定更精准的治疗方案。

2018年8月13日,天津诺禾致源生物信息科技有限公司的III类医疗器械创新产品“人EGFR、KRAS、BRAF、PIK3CA、ALK、ROS1基因突变检测试剂盒(半导体测序法)”
通过了国家药品监督管理局的审批,正式获准上市销售。该产品此前已获创新医疗器械特别审批通道资质。该产品批准用于检测非小细胞肺癌(NSCLC)患者肿瘤组织FFPE样本中与靶向治疗密切相关的六个基因的突变状态,筛选适合接受靶向药物治疗的患者。

Met 14 外显子跳跃

该多基因检测试剂盒覆盖与NSCLC靶向治疗用药相关的六个基因,其中EGFR、ALK和ROS1基因获批可用于靶向药物的伴随诊断检测,为临床医生用药提供参考。与传统基因检测手段相比,基于NGS技术的多基因检测试剂盒,只需一份组织样本、一次检测即可覆盖多个肿瘤治疗相关基因,实现点突变、插入缺失、融合等多种变异形式的检测,为患者提供更全面的靶向治疗的解决方案。

2014年7月,美国癌症基因研究组(The Cancer Genome Atlas, TCGA)通过对
mRNA和 DNA
高通量测序结果及序列比对分析,发现约4%(10/230)肺腺癌存在MET14外显子剪接位点突变,导致
MET 第 14 外显子在 mRNA 水平出现部分或完全跳跃缺失突变
(exon14-skipping)。

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2015年5月,Paik 等在178 例 VI 期肺腺癌中发现 8 例 MET exon14
缺失(发生率约 4%),4 例患者接受克唑替尼或卡博替尼,1例获得 CR、3 例
PR。2016年,克唑替尼治疗MET14-skiping正式进入NCCN指南。从新靶点的发现到药物适应症的扩大,高通量测序技术为肿瘤诊疗方式的飞速发展奠定了坚实的基础。

2018年7月23日,国家药品监督管理局经审查,批准了广州燃石医学检验所有限公司的高通量检测创新产品
人EGFR/ALK/BRAF/KRAS基因突变联合检测试剂盒(可逆末端终止测序法)”三类医疗器械产品的注册。

NTRK基因融合

该试剂盒是中国首个基于高通量测序技术(NGS)以及伴随诊断标准审批的多基因肿瘤突变联合检测试剂盒,将用于帮助非小细胞肺癌患者精准选择靶向药物治疗的方式。2016年9月,国家药品监督管理局批准该试剂盒作为中国首个肿瘤NGS检测产品进入
“创新医疗器械特别审批程序”。而几乎整整两年后,历经临床试验大量临床样本的严谨验证,通过注册生产质量体系的审查考核,国家药品监督管理局终于颁出这意义深远的
“肿瘤NGS第一证”。

2018年2月21日,新英格兰医学杂志(NEJM)公布了larotrectinib(LOXO-101)同时进行的三项安全性和有效性研究结果(NCT02122913,NCT02637687和NCT02576431),对于年龄为4个月至76岁的患者,针对17种不同癌症治疗总体应答率为75%。

与传统基因检测手段相比,通过NGS技术,患者只需经过一次检测,即可同时了解多个肿瘤治疗相关基因的热点及非热点突变全景,并囊括点突变、插入缺失、重排(融合)等多种变异形式,为医生及患者提供多种靶向药物的一站式检测解决方案,节省检测样本和检测时间。

作为LOXO-101的主要靶点之一,NTRK基因融合已成为临床关注的热点。该融合基因的检测极有可能成为下一个获批上市的伴随诊断。高通量测序凭借其在多基因并行检测中的优势,能够在检测panel设计之初便将此类颇具临床应用前景的基因囊括其中,不断适应临床对新靶点的检测需求。

公司平台方法检测基因燃石医学NGS可逆末端终止测序法EGFR、ALK、BRAF、KRAS诺禾致源NGS半导体测序法EGFR、KRAS、BRAF、ALK、PIK3CA、ROS1艾德生物PCRADx-ARMSEGFR、ALK、KRAS、BRAF、ROS1

突变丰度与药效的相关性分析

三个产品都是多基因检测在临床应用的新纪元,但产品又都是肿瘤多基因检测试剂盒,从检测基因数量上看,燃石医学最少,只有四个,艾德生物比燃石医学多一个ROS1基因,诺禾致源又比艾德生物多一个PIK3CA基因;从平台上看,NGS有NGS的优势,PCR也有PCR的优势,王婆卖瓜总归是自夸自卖,例如艾德生物和燃石医学都表示可以节省检测时间,PCR的强调准确,NGS的强调节省样本。

突变丰度与药效具有显著的相关性,对肿瘤突变信息的深度挖掘能够为临床研究提供更广阔的思路。根据大量的临床实践经验及报道,携带EGFR
19del与携带L858R变异的NSCL患者对EGFR-TKI的响应有着显著的差异。且药效与突变丰度呈正相关。在携带潜在耐药的共突变患者中,EGFR-TKI疗效显著低于未发生共突变的患者。NGS技术能够为临床带来包含突变丰度、共突变情况的全面肿瘤基因变异信息,能够更精确地指导临床对靶向药物的使用。

小编也是门外汉,只能看个热闹,搞不清三家产品到底是有各自优势,还是有一家是最好选择,毕竟试剂盒进入市场之后,就面临着医院检验科和医学实验室的选择,也影响临床医师的选择,最后影响到肿瘤患者靶向药物的选择,对最终疗效产生影响。返回搜狐,查看更多

NGS技术为临床带来的革新

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传统分子病理检测手段(ARMS、IHC、FISH等)虽已被广泛应用于肺癌分子病理检测的日常工作中,然而面对逐渐增多的靶点和药物,传统检测手段的局限性也愈发凸显。多基因并行检测方式需要消耗大量的临床样本,穿刺活检等小样本的检材可能无法满足检测需求;有限的基因变异信息同时制约了肺癌靶向治疗的精细化、精准化发展;逐项累加的检测费用也加重了患者的经济负担。

高通量测序技术的出现为临床分子病理检测提供了全新的工具。一次检测提供全面肿瘤基因变异信息的同时,对临床样本和患者花费的节省极大地提高了多基因并行检测的可及性。借助高效的DA8600高通量测序平台,该试剂盒仅需4天即可完成从样本接收到报告出具的全部流程。为临床的肿瘤NGS分子病理检测提供了完整的解决方案。

澳门新葡亰,展望

回顾过去,肿瘤高通量测序的注册申报之路道阻且长,展望未来,临床对肿瘤高通量测序的需求必将与日俱增。作为NGS技术在肿瘤临床应用中的排头兵,目前获批的小panel
NGS检测试剂盒远未发挥出高通量测序技术的核心价值。能够对包含更多靶点和信号通路基因的大Panel、全外显子、乃至全基因组进行分析才是NGS技术不可替代的优势。随着药物临床试验的推进,诸如肿瘤突变负荷(TMB)和同源重组修复缺陷(HRD)检测的应用价值已逐渐浮现,在可见的未来,更多以NGS技术为基础的伴随诊断也将进入临床,共同推动肿瘤诊疗的精细化、精准化。

参考资料:

[1] Matteo Canale, et.al, Impact of TP53 Mutations on Outcome in
EGFRMutated Patients Treated with First-Line Tyrosine Kinase Inhibitors,
Clinical Cancer Research. 2016 Oct 25.

[2]Cancer Genome Atlas Research, N. Comprehensive molecular profiling
of lung adenocarcinoma. Nature 2014; 511:543-50; PMID:25079552.

[3]Targeted Therapy Shows Continued Promise in Patients Whose Tumors
Had NTRK Gene Fusions. AACR 4/17/2016.

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